常驻代表机构在中国境内从事居间介绍、代理等服务取得的佣金、回扣、手续费和报酬，其应缴纳的营业税，按收入额计算，税率为5％；企业所得税的税率为 30％，地方所得税的税率为3％，其应纳税所得额，可根据情况分别适用按实申报，核定收入额或所得额，以及以其经费支出额换算收入额等三种方法进行计算：
1、按实申报
    常驻代表机构如果能够提供所签订合同、佣金率等全部资料、凭证，并且设有帐册，进行财务收支和成本费用核算，其中，境外费用支出部分还能够提供当地注册会计师证明的，经主管税务机关审核同意，可按实申报收入额和所得额，计算应税额。
2、核定收入额或所得额
    常驻代表机构如仅能提供在中国境内从事居间介绍、代理等服务签订的全部合同资料，在合同中载明佣金金额的，可以按合同规定的金额计算纳税；在合同中没有载 明佣金金额或者属于同一常驻代表机构的多项业务合同，其中只有一部分合同载明佣金金额，而不能提供准确的证明文件和正确申报收入额的；或者不能提供准确的 成本、费用凭证，正确计算应纳税所得额的，经主管税务机关审查同意，可以核定其收入额或所得额计算纳税。
    对收入额的核定：以介绍商品成交额的3％（佣金率）核定为佣金收入（业务收入），对从事广告代理业务的常驻代表机构，按合同协议成交额的15％为业务收入额。
对所得额的核定：以常驻代表机构的业务收入额的10％（核定利润率）为应纳税所得额。
    常驻代表机构能够提供有关凭证、资料,如接受委托业务的委托协议书或其他相当的证明文件,证明其在一项代理业务中,有一部分业务是由其总机构在中国境外进行的，经当地税务机关审核，可以按其收入额的50％核定为应在中国纳税的收入额，再按核定利润率计算应纳税所得额。
3、按经费支出额换算收入额
    从1998年4月1日起，常驻代表机构购置固定资产（如房屋、汽车、计算机等）所发生的支出，以及代表机构设立时或者搬迁等原因所发生的装修费支出，可以 在发生时一次性作为代表机构费用支出换算收入计税。若代表机构所发生的上述费用支出数额较大，代表机构一次性作为费用换算收入纳税有困难的，如代表机构能 够设置、保存完整的帐册、凭证，能够准确核算并记录上述费用的摊销情况以备税务机关核查的，对购置固定资产所发生的支出，可按税法实施细则第三十五条规定 的同类固定资产的最短折旧年限，不留残值，平均摊入代表机构经费换算收入计算纳税；对装修费支出，可按5年平均摊入代表机构经费换算收入计算纳税。代表机 构以货币形式用于我国境内公益、救济性质的捐赠，可不计入代表机构用以换算收入计税的经费支出额。